虽然我国水果产业已取得长足发展，但仍面临种种问题。首先，由于生产端小、散、乱情况的长期存在，与渠道难以及时、有效匹配，导致水果产业供需不配套这一突出问题得不到解决，丰收不增收的现象经常出现。
　　其次，水果从生产到市场，包括优良品种选育、果园管理、采后预冷和贮藏、上市前的商品化处理以及运输和上市销售，整个产销链的每一个环节都应有相对应的标准，但从目前现状来看，要么无标准可依，要么标准散乱难以统一，要么标准内容过时，严重制约了我国水果的品牌化进程。
　　第三，从整个水果行业来看，冷链物流应用程度较低，有的甚至全程无冷链，导致某种水果早上卖10元、晚上卖5元甚至更低的现象时常出现，严重影响了消费者的体验和水果的利润水平。
　　今后随着市场竞争加剧，水果行业面临的问题将更加凸显，单靠拼价格、拼地段的时代将结束，未来拼的是精细化运营管理，从采购、仓储、陈列、产品结构、定价、包装、配送、营销设计、人员管理都需要一整套运营体系来支撑。